Nav ieteicams izmantot parasto ūdeni siltumnīcas sienu mazgāšanai no iekšpuses. Visbiežāk izmanto pārtikas sodas šķīdumu, atšķaidot 10 litru ūdens spaini ar 30 gramiem sodas.
Tāpat efektīvi ir sinepju, etiķa, ziepju šķīdumi un citi dezinfekcijas līdzekļu šķīdumi.
Sienu mazgāšanas laikā ir jāpievērš uzmanība zirnekļu tīkliem un lapseņu pūžņiem. Izmantotā šķīduma paliekas ir jānoskalo ar parastu ūdeni.
Jāmazgā ne tikai siltumnīcas sienas, bet arī metāla trubas, elektroapgādes vadi un apkures konstrukcijas.